El acervo de la BCAyB está organizado de acuerdo con el sistema de clasificación de la Biblioteca del Congreso (Library of Congress), el estándar de organización documental de más uso en las bibliotecas académicas del mundo.
El acervo documental está integrado por material que apoya los programas académicos de las diversas carreras de las Facultades de Agronomía y Medicina Veterinaria y Zootecnia, Escuelas a las que principalmente brinda sus servicios.
Los fondos que integran el acervo son los siguientes:
Acervo de la biblioteca: Libros: 14,181 títulos y 22,816 volúmenes Revistas: 843 títulos y 13,942 fascículos Tesis: 8,816 títulos y 13,713 volúmenes Videos: 220 títulos y 592 volúmenes Mapas: 3,128 títulos y 7,914 volúmenes Obras de arte (Óleos): 2 Mural en Cerámica: 2 Acrílico sobre cemento: 1